إخلاء المسؤولية: لا تعتبر مقالات الإصدار المبكر إصدارات نهائية. ستنعكس أي تغييرات في النسخة الإلكترونية في الشهر الذي يتم فيه إصدار المقالة رسميًا.
علاقة المؤلف: مكتب حماية الصحة، وزارة الصحة بولاية مينيسوتا، سانت بول، مينيسوتا، الولايات المتحدة الأمريكية (D. Evans, A. LaPointe, C. Peel, K. Bo-Subait, E. Dufort, J. Kaiyalethe, B. Craft, M. Plumb, B. Weber, L. Bohnker-Voels, K. Pung, A. Mondelli, J. Garfin, S. Namogenyi, P. سنيبس-فاجنون، إم إي جيلستروم، ك. كومو-سابيتي، ر. لينفيلد)؛ جامعة مينيسوتا، مينيابوليس، مينيسوتا، الولايات المتحدة الأمريكية (ج. ستيوارت)؛ هينيبين للرعاية الصحية، مينيابوليس (ج. ستيوارت)
العامل الممرض الذي ينتقل عن طريق الاتصال الجنسي النيسرية السيلان يمكن أن ينتشر من الأنسجة المخاطية في مواقع التعرض إلى أماكن أخرى في الجسم، مما يسبب عدوى المكورات البنية المنتشرة (DGI) (1). في عام 2024، بدأت وزارة الصحة بولاية مينيسوتا (الولايات المتحدة) تحليل تسلسل الجينوم الكامل (WGS) للعزلات من جميع حالات DGI في الولاية (2). تعتمد هذه المقالة على بحثنا السابق منذ عام 2024 (2).
في عام 2025، استمرت حالات الإصابة بمرض DGI في ولاية مينيسوتا في الحدوث بمعدلات أعلى مقارنة بخط الأساس 2020-2023. تتطلب قواعد الإبلاغ في ولاية مينيسوتا ذلك ن. السيلان يتم تقديم عينات من المواقع المعقمة عادة إلى مختبر الصحة العامة بالولاية. يعتبر تحليل هذه الحالات والعينات المرتبطة بها مراقبة معززة وبالتالي يعتبر معفى من موافقة مجلس المراجعة المؤسسية.
لقد أجرينا WGS باستخدام منصات Illumina MiSeq أو NextSeq أو MiSeq i100 (https://www.illumina.com) وأجرى التحليلات الوبائية الجزيئية كما هو موضح سابقًا (2). كشفت أبحاثنا الجينية أن نوعًا جديدًا من التسلسل متعدد البؤر (ST)، ST16676، ظهر في صيف عام 2025 (3,4). خلال الفترة من يونيو إلى سبتمبر 2025، قمنا بتسلسل 14 عزلة من حالات DGI التي تم تعيين جينوماتها إلى ST16676. جميع الجينومات الـ 14 مشفرة لـ أ porB1a أليل، جين مقاومة التتراسيكلين نقطة (م)جين بيتا لاكتاماز ذو الطيف الممتد بلاهتيمالنوع الرابع عشر غير الفسيفسائي penA الأليل، وتسلسل الجزيرة الوراثية للمكورات البنية (الشكل 1؛ جدول الملحق، الشكل 1) (3–6). ولم تتطابق تلك الجينومات مع أي جينومات موثقة ن. السيلان نوع التسلسل بناءً على ملفات تعريف مقاومة مضادات الميكروبات (5). تسلسل القراءة الطويلة (أكسفورد نانوبور تكنولوجيز، https://nanoporetech.com) من 4 عزلات ST16676 حلت المشكلات المكتسبة باستمرار نقطة (م) و بلاهتيم الجينات على تسلسلات بلازميدية منفصلة تبلغ 42 كيلو بايت و 5.6 كيلو بايت و porB1a أليل على الكروموسوم البكتيري.
وفي أكتوبر 2025، أجرينا مقارنة عالمية لتلك الجينومات مع غيرها في قاعدة بيانات المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية للكشف عن مسببات الأمراض (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens). قامت تلك المقارنة بتجميع الجينومات في مجموعة (PDS000214546.4) مع اثني عشر جينومًا آخر (الملحق الشكل 2). أظهر تحليل تلك الجينومات الـ 26 باستخدام خط أنابيب Dryad الإصدار 3.0 أن جينومات Minnesota DGI تباينت في التشابه الوراثي مع بعضها البعض بنسبة 0-62 (الوسيط 6) تعدد الأشكال النوكليوتيدات (SNPs) وإلى الجينومات الـ 12 الأخرى بنسبة 215-320 (المتوسط 248) SNPs (الشكل 2) (Dryad، https://github.com/wslh-bio/dryad). أظهر التحليل الديناميكي التكراري لتلك الجينومات أن 28 من التكرارات الـ 32 تقاربت في أوائل مايو 2025، قبل أسابيع من طلب أول مريض للرعاية، كوقت تقديري لأحدث سلف مشترك لجميع جينومات مينيسوتا الأربعة عشر (الملحق).7).
أكمل علماء الأوبئة التحقيق في حالات ST16676 DGI بناءً على نتائج المراقبة الجينية. من بين 13 مريضًا مصابًا بـ ST16676 تمت مقابلتهم، كان 12 (92.3٪) يعيشون في مينيابوليس سانت. منطقة بول بلومنجتون الحضرية؛ كان 11 (84.6٪) رجالًا واثنتين (15.5٪) سيدات، و9 (69.2٪) تتراوح أعمارهم بين 15 و44 عامًا. أبلغ سبعة (53.8٪) من المرضى عن لقاءات جنسية مجهولة مع شركاء متعددين، أبلغ ثلاثة منهم (23.1٪) عن تعاطي المخدرات أثناء القيام بذلك. أبلغ اثنان (15.4٪) عن استخدام العلاج الوقائي بعد التعرض للدوكسيسيكلين. أبلغ تسعة (69.2٪) من المرضى عن حالات عدوى سابقة تنتقل عن طريق الاتصال الجنسي؛ أبلغ أربعة (44.4٪) عن إصابتهم بالسيلان وخمسة (55.5٪) عن فيروس نقص المناعة البشرية. وأكد التحقيق الوبائي وجود صلة مباشرة بين حالتين حيث كانت جينومات العزلات متطابقة وراثيا عند 0 SNPs. كان لدى المريض الرابع عشر، الذي رفض المقابلات، معزولة مماثلة للمعزولتين المرتبطتين ارتباطًا مباشرًا عند 0 SNPs، ويعيش في ولاية مجاورة، ويتلقى رعاية للعدوى في مينيسوتا.
وكانت نتائج اختبار الحساسية للمضادات الميكروبية متاحة في السجلات الطبية لـ 10 (71.4%) من 14 مريضًا مصابًا بالـ ST16676. وفقا لنتائج ن. السيلان نوع التسلسل بناءً على مقاومة مضادات الميكروبات وتحليلات AMRFinderPlus (5,6) أظهرت جميع العزلات العشرة مقاومة مظهرية للتتراسيكلين والسيبروفلوكساسين وحساسية مظهرية للسيفترياكسون.
اكتشفت WGS المستقبلية ظهور سلالة مقاومة للتتراسيكلين ن. السيلان التي حلت محل الأنواع المرتبطة بـ DGI السائدة في العام السابق. الظهور المفاجئ للأنواع المرتبطة بـ DGI والذي يعد أ porB1a أليل (8) وجين مقاومة التتراسيكلين الموجود على البلازميد القابل للتعبئة يثير قلقًا وبائيًا نظرًا لاستخدام العلاج الوقائي بعد التعرض للدوكسيسيكلين لتقليل المرض المحتمل ومخاطر انتقال مرض السيلان لاحقًا (9). علاوة على ذلك، فإن وجود جينين مقاومين لمضادات الميكروبات على البلازميدات القابلة للتعبئة بشكل منفصل يسلط الضوء على أهمية مراقبة نقل الجينات الأفقي في المراقبة الجينومية للبكتيريا. ن. السيلان.
تسلط النتائج التي توصلنا إليها الضوء على أهمية مراقبة DGI وقيمة المراقبة الجينومية للأمراض المنقولة جنسياً. سمح التحقيق السريع للحالة، مدفوعًا بالتحليل الجيني، لعلماء الأوبئة بتحديد الرابط المباشر بين حالات الإصابة بالمرض وإخطار إدارة الصحة في الولاية المجاورة بانتقال العدوى. قدمت الأساليب الديناميكية الديناميكية أيضًا نظرة ثاقبة حول المعدل الذي قد تنشأ به السلالات المرتبطة بـ DGI من خلال تقدير جدول زمني من أسابيع إلى أشهر بين الوقت المقدر لأحدث سلف مشترك للسلالة والوقت الذي طلب فيه المرضى المصابون الرعاية في مرافق الرعاية الصحية. مواصلة المراقبة الجينومية المستقبلية، بما في ذلك إجراء دراسات واسعة النطاق حول تطور العوامل المسببة للمرض ن. السيلان سلالات، سيساعد هذا المجال على فهم هذا التهديد للصحة العامة والتدخل فيه بشكل أفضل.
هذه المقالة مطبوعة مسبقًا على https://doi.org/10.64898/2026.01.09.26343522.
السيد إيفانز هو عالم أوبئة جينية في وزارة الصحة بولاية مينيسوتا. ويركز عمله على تطوير وتنفيذ وتحسين استخدام الجينوم الميكروبي لمراقبة مسببات الأمراض والتدخل في تفشي المرض.
قمة
نشكر Amber Poppe على دعمها لهذه الدراسة الوبائية. ونشكر أيضًا مارسي بابكوك، وجيفري دينيس، وهانا فريدلاندر، وبريان كيندريك، وداكوتا شنايدر، وجنيفر زيبريتش على دعمهم لمراقبة الأمراض المنقولة جنسيًا في مينيسوتا. نحن نشكر جون سي. كارتي وسانديب جيه جوزيف لإجراء المراقبة الجينومية على المستوى الوطني والتي وضعت نتائج أبحاثنا المحلية في سياقها. نشكر أيضًا فريق المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية للكشف عن مسببات الأمراض، وكذلك جميع مقدمي الرعاية الصحية في مينيسوتا وويسكونسن الذين قدموا الرعاية السريرية للمرضى الذين يعانون من عدوى المكورات البنية المنتشرة وأبلغوا وزارة الصحة في مينيسوتا عن الحالات.
يقرأ التسلسل وتجميعات الجينوم لـ ن. السيلان الجينومات المتسلسلة لهذه الدراسة متاحة للجمهور من المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (BioProject No. PRJNA1204341).
تم توفير التمويل لهذا البحث من خلال المنح الممولة من مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها التالية: جائزة تعزيز الوقاية من الأمراض المنقولة جنسياً ومكافحتها للإدارات الصحية (المنحة رقم NH25PS005172)، برنامج العدوى الناشئة (المنحة رقم NU50CK000648)، علم الأوبئة وقدرة المختبرات (المنحة رقم NU51CK000361 وNU50CK000508)، و مراكز التميز في علم الجينوم المسببة للأمراض (رقم المنحة NU50CK000628). لا تعكس النتائج بالضرورة وجهات النظر الرسمية للوكالات التي مولت هذا العمل.
