إخلاء المسؤولية: لا تعتبر مقالات الإصدار المبكر إصدارات نهائية. ستنعكس أي تغييرات في النسخة الإلكترونية في الشهر الذي يتم فيه إصدار المقالة رسميًا.
علاقة المؤلف: معهد روبرت كوخ، برلين، ألمانيا (C. Kohl, T. Muzeniek, T. Perera, D. Bas, M. Öruc, A. Brinkmann, B. Becker-Ziaja. F. Schwarz, A. Nitsche); جامعة كولومبو، كولومبو، سريلانكا (S. Siriwardana، T. Perera، J. Weerasena، S. Handunetti، IC Perera، S. Premawansa، W. Yapa)؛ وزارة الصحة، كولومبو (هـ. جيفاثاران)؛ مستشفى شمال كولومبو التعليمي، راجاما، سريلانكا (جي بريماوانسا)
فيروس نيباه (NiV؛ فيروس هينيبا نيبيهنسي) وفيروس هيندرا (H. هندرينس) هي أنواع داخل الجنس فيروس هينيبا من فصيلة الفيروسات المخاطانية (1). تسبب العديد من الفيروسات المخاطانية، بما في ذلك فيروس الحصبة والفيروس المخلوي التنفسي، أمراضًا تنفسية حادة وغالبًا ما تكون قابلة للانتقال بشكل كبير عن طريق الهواء. يمكن أن يسبب NiV تفشيًا خطيرًا لدى البشر؛ تتراوح الأعراض السريرية من عدوى تحت الإكلينيكي إلى التهاب الدماغ الحاد وأمراض الجهاز التنفسي والوفاة (2). معدل الوفيات المبلغ عنه (CFR) في التهاب الدماغ NiV هو 61% (95% CI 45.7%-75.4%) (2,3).
تأسست شركة NiV عام 1998 في ماليزيا وسنغافورة (4). وتم الإبلاغ عن حالات تفشي لاحقة في بنغلاديش والفلبين والهند؛ وأسفرت عن أكثر من 643 إصابة مؤكدة مختبريًا و380 حالة وفاة (2). الخفافيش (الثعالب الطائرة، التيروبوس spp.) هي مضيفات الخزان المعروفة لـ NiV (5). يحدث انتقال العدوى من الخفافيش إلى البشر عن طريق التعرض للبول، إما من خلال استهلاك عصارة النخيل الخام الملوثة بفضلات الخفافيش، أو الاتصال المباشر مع المضيفين الوسيطين المصابين (مثل الخنازير)، أو الاتصال المباشر ببول الخفافيش.5). في عام 2023، تم الإبلاغ عن عدة حالات من فيروس نيباه في كوزيكود، منطقة كيرالا، الهند، وفي مقاطعات دكا وراجباري وشارياتبور في بنغلاديش.6). أقصر مسافة بين جزيرة مانار، سريلانكا، وناتاراجابورام، الهند، هي أقل من 55 كم؛ التيروبوس النيابة. تم الإبلاغ عن أن الخفافيش تهاجر بسهولة لمسافة تزيد عن 450 كيلومترًا (7). في هذه الدراسة قمنا بمراقبة البول الذي تفرزه عدة مستعمرات P. المتوسط الخفافيش في سريلانكا لوجود الفيروسات باستخدام التقنيات الجزيئية. كان تركيزنا على التحقق من وجود NiV في سريلانكا وتحديد التدابير اللازمة لمنع انتقال العدوى إلى البشر. لقد حصلنا على الموافقة الأخلاقية لهذه الدراسة من معهد الأحياء في سريلانكا (WL/3/2/05/18) والإذن اللازم من إدارة الحفاظ على الحياة البرية في سريلانكا.
رصدنا في الفترة مارس 2018 – يونيو 2019 P. المتوسط مستعمرات الخفافيش لطرح مسببات الأمراض في كولومبو، ومانار، وأنورادهابورا، وبادولا، بسريلانكا. وضعنا أوراق عينات نظيفة تحت الأشجار في الصباح الباكر وقمنا بنقل قطرة البول المفرزة قطرة إلى ألواح ميكروتيتر معقمة باستخدام ماصات يمكن التخلص منها في الصباح. قمنا بتنفيذ جميع الأعمال مرتدين معدات الحماية الشخصية المناسبة (PPE) كما هو موضح سابقًا (5).
قمنا بجمع إجمالي 2218 عينة بول ودمجناها في 32 مجموعة <8 عينات بول لكل منهما. لقد استخرجنا الحمض النووي الريبي (RNA) من المجمعات الفردية باستخدام QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN، https://www.qiagen.com). أجرينا فحص فيروس Nipah باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) في الوقت الحقيقي الذي يستهدف جين البروتين الفوسفوري (P)، كما هو موضح سابقًا (8). وكتأكيد إضافي، قمنا بتطوير تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي الذي يستهدف بروتين القفيصة النووية لجينوم فيروس نيباه (الجدول 1).
استخدمنا Illumina HiSeq (https://www.illumina.com) لتسلسل تجمعات NiV الإيجابية S3_P02 وS18_P08 (2 من 32 تجمعًا). لقد قلصنا مع Trimmomatic (9) وتم تعيينها لسلالة NiV MCL-18-H-1088 (رقم الانضمام MHK523642؛ ولاية كيرالا، الهند) كسلالة مرجعية. بالإضافة إلى ذلك، قمنا بتطوير لوحة التمهيدي AmpliSeq، NiVliSeq، التي تغطي جينوم NiV بأكمله باستخدام الإصدار Primer3 2.3.7 (الشكل 1؛ جدول الملحق). قمنا بتسلسل منتجات PCR المقابلة على منصة MiniIon كما هو موضح سابقًا (10,11). لقد قدمنا مسودة الجينوم إلى GenBank (رقم الانضمام PP893186-9) وقمنا بمواءمتها مع سلالات NiV وأنواع جينومات الفيروس المخاطاني التي أشارت إليها اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات والمتاحة في GenBank. قمنا بحساب إعادة البناء التطوري للساعة الجزيئية باستخدام برنامج MrBayes الإصدار 0.39 (https://nbisweden.github.io/MrBayes) باستخدام نهج سلسلة ماركوف مونت كارلو لإعادة بناء الساعة الجزيئية بناءً على النموذج العام القابل للعكس مع المعلمات المحددة عند مليون نسخة متماثلة و 4 سلاسل وحرق بنسبة 10٪ (تسلسل رئيسي جزئي 7977 nt ؛ ترميز جين بوليميريز RNA المعتمد على الحمض النووي الريبي (RNA) ، من الفصيلة الفرعية Orthoparamyxovirinae).
لقد جمعنا حمام السباحة S3_P02 وحمام السباحة S18_P08 في كولومبو؛ تم اختبار كلاهما بشكل إيجابي لـ NiV باستخدام PCR الكمي لفيروس henipavirus (qPCR) الذي يستهدف الجين P (8). أكد NiV qPCR (الذي يستهدف الجين النووي القفيصة) NiV أيضًا في نفس مجموعات العينات (الجدول 2). كشف التسلسل عن قيم NiV مماثلة في مجموعتي العينات التي قمنا بتعيينها عبر جينوم NiV بأكمله (الجدول 2)، مما يوفر تأكيدًا إضافيًا. كشف نهج NiVliSeq عن 93% من جينوم NiV من المجموعة S3_P02 و98% من جينوم NiV للمجموعة S18-08 (الجدول 2). كشفت مقارنة جينومات NiV مع قاعدة بيانات GenBank عن أعلى هوية لسلالة تم جمعها من مريض بشري أثناء تفشي المرض عام 2018 في ولاية كيرالا، الهند (رقم الانضمام MH396625)؛ كان لكل من الجينومات من المجموعة S3_P02 والمجموعة S18-08 هوية نيوكليوتيدات بنسبة 98٪ لسلالة كيرالا. قمنا بتسمية سلالات سريلانكا NiV وفقًا للنظام المستخدم في سلالات الهند: سلالة NiV C-18-B-0302 سريلانكا (رقم الانضمام PP893186.1) وسلالة NiV C-19-B-1808 سريلانكا (رقم الانضمام PP893188.1). في هذه التسمية، يشير C إلى كولومبو، ويشير 18 و19 إلى عامي 2018 و2019، ويشير B إلى الخفافيش، وتمثل الأرقام المتبقية رقم العينة.
قام التحليل الوراثي بتعيين سلالات فيروس نيباه الجديدة C-18-B-0302 سريلانكا وC-19-B-1808 سريلانكا إلى نوع فيروس نيباه (ح.نيباهنسي) داخل الجنس فيروس هينيبا (الشكل 2). يتجمع كلاهما بشكل أحادي مع السلالات المأخوذة من البشر أثناء تفشي المرض في منطقة كيرالا بالهند في الأعوام 2007 و2018 و2019 و2021 و2023.
أظهرت هذه الدراسة وجود سلالات NiV في سريلانكا. لقد قمنا بتطوير نهج التسلسل qPCR وNiVliSeq الذي تم التحقق من صحة النتائج التي تم الحصول عليها مسبقًا ويمثل أدوات قيمة يمكن استخدامها في مزيد من الدراسات. تُظهر السلالات التي تم تحديدها أكبر أوجه التشابه مع السلالات المسببة للأمراض البشرية التي تسببت في تفشي المرض مؤخرًا في الهند (2007 و2018 و2019 و2023). ومع ذلك، لا يزال NiV مرضًا نادرًا ومعدلات انتقاله منخفضة نسبيًا. علاوة على ذلك، فإن اكتشاف فيروس معين في مجموعة من الخفافيش لا يعني بالضرورة حدوث انتقال؛ يمكن العثور على سلالات مختلفة من فيروسات henipavirus التيروبوس النيابة. الخفافيش في جميع أنحاء مداها.
يجب أن تكون الوقاية الأولية من العدوى المحتملة أحد الأهداف الرئيسية ويمكن أن تشمل حماية الخفافيش ومجاثمها. تعتبر مستعمرات الخفافيش حيوية للنظم البيئية الصحية وتحتاج إلى الحماية لعدة أسباب، بما في ذلك خدمات النظام البيئي التي تقدمها، مثل التلقيح ونثر البذور. علاوة على ذلك، التيروبوس النيابة. الخفافيش مهددة بالانقراض (12). أدركت منظمة الصحة العالمية (WHO) الحاجة إلى البحث وتشخيص فيروس NiV ضمن نطاقه التيروبوس النيابة. (13).
من المرجح أن يؤدي فهم الآليات التي تؤثر على إفراز النيكل إلى منع المزيد من الانتشار؛ من المحتمل أيضًا أن يتبع تساقط النيكل نبضات موسمية ومؤقتة تم الإبلاغ عنها سابقًا لفيروس هيندرا (14–15). نحن ندرك أن ظهور المرض قد يكون نتيجة لاضطراب داخل النظم البيئية، وبالتالي لا يمكن تخفيفه عن طريق المزيد من الاضطراب. باعتبارها دولة استوائية، تتمتع سريلانكا بأنظمة بيئية معقدة ومتنوعة؛ وقد تكون قدرتها على الصمود في مواجهة تغير المناخ أفضل من صمودها في مناطق أخرى من العالم.
يمكن التقليل من احتمالية انتقال فيروس NiV من الخفافيش إلى البشر من خلال التدابير الوقائية. ويمكن أن تشمل هذه التدابير تثقيف العاملين في مجال الرعاية الصحية لرفع مستوى الوعي المناسب حول NiV، والمعدات والتدريب للكشف المبكر عن NiV RNA في العينات السريرية، والتحضير للعلاج السريري للمرضى إيجابيي NiV، وإعلام الجمهور حول تجنب طرق العدوى المعروفة لمنع انتقال العدوى (على سبيل المثال، سياجات دائرية من الأشجار مع الخفافيش).
الدكتور كول هو عالم في معهد روبرت كوخ في برلين، ألمانيا، في مركز التهديدات البيولوجية ومسببات الأمراض الخاصة. اهتماماتها البحثية هي الكشف عن الفيروسات الناشئة والناشئة وتوصيف مسببات الأمراض الجديدة، وخاصة من الخفافيش.
قمة
